XVIII Симпозиум по межмолекулярному взаимодействию

и конформациям молекул

и школа "Компьютерное моделирование структуры и межмолекулярных взаимодействий в конденсированных фазах"

20–24 июня 2016 года, Ярославль

Общая информация Регистрационный взнос Регистрация Тезисы докладов Место проведения Проживание Школа Доклады молодых ученых История Симпозиумов Контакты

ИЗУЧЕНИЕ ГЕОМЕТРИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ КОМПЬЮТЕРНЫХ МОДЕЛЕЙ МЕТОДОМ ВОРОНОГО-ДЕЛОНЕ В.П. Волошин Институт химической кинетики и горения им. В.В. Воеводского СО РАН, Новосибирск Моделирование является специфическим способом познания реального мира, при котором вместо объектов этого мира изучаются их копии, созданные согласно определенным правилам. Информация о модели, которая может быть получена и для реального объекта-прототипа, позволяет определить степень соответствия модели прототипу. Однако для моделей можно получить и другую информацию, принципиально недоступную при изучении реального объекта. Для компьютерной модели, в отличие от реального вещества, мы знаем положение каждого атома в любой момент времени. Это позволяет изучать структуру модели детально: определять взаимное расположение атомов, искать закономерности этого расположения. Одним из наиболее продуктивных способов анализа геометрической структуры атомарных компьютерных моделей является метод Вороного–Делоне. Он основан на работах двух математиков – Георгия Феодосиевича Вороного (1868–1908) и Бориса Николаевича Делоне (1890–1980). В данном подходе реализованы математически строгие способы разбиения пространства модели на структурные элементы: на многогранники Вороного, характеризующие пространство вокруг каждого атома, и на симплексы Делоне, описывающие пустое пространство между ближайшими атомами. Разбиение на элементы каждого вида производится однозначно, без зазоров и наложений. Любая атомная конструкция может быть представлена как объединение многогранников Вороного соответствующих атомов, а любая сложная межатомную полость как объединение элементарных полостей внутри симплексов Делоне, составленных из атомов, окружающих данную полость. Связь, существующая между данными разбиениями, позволяет решать и другие задачи. В лекции будут изложены основные понятия метода Вороного–Делоне, показаны виды разбиения, используемые для упаковок одинаковых атомов и атомов разного размера, представлены конкретные примеры применения данного метода для изучения структуры различных молекулярных систем.